据日本媒体报道，16号凌晨，奄美诸岛居民及游客接到海啸警报后连夜到高处避难，道路一度发生拥堵。日本大范围地区交通受到影响，日本航空公司往来奄美大岛国内航线27个航班停航，部分地区铁路和渡轮停运。截至16号下午4点，高知县、三重县和德岛县共计21艘船只沉没或倾覆。