从横琴粤澳深度合作区官方网站获悉，合作区组织架构、机构领导名单，以及各工作机构职责已正式公布。合作区管理委员会下设执行委员会和秘书处(与执行委员会合署办公)，执行委员会下设行政事务局、法律事务局、经济发展局、金融发展局、商事服务局、财政局、统计局、城市规划和建设局、民生事务局等九个局。合作区管理委员会由粤澳双方联合组建，统筹决定合作区重大规划、重大政策、重大项目和重要人事任免等。合作区主任由广东省委副书记、省政府省长马兴瑞，澳门特别行政区行政长官贺一诚共同担任。