在粤港澳大湾区建设国际科技创新中心过程中，需要优化完善城市科技创新生态系统。以深圳市为例，当前形成了垂直与水平相结合的区域协同、龙头企业带动演进的产业协同、借力“外脑”联合创新的政企协同、多元联动共建共享的校企协同的多方协同体系。

深圳未来仍需要链接创新绩效、创新教育、创新资源、创新环境、创新服务“五大要素”，打造产业协同、区域协同、政企协同、校企协同“四大平台”，全面深化教育体制改革,加大科技创新教育投入,提高创新型企业待遇,发扬移民创新精神,营造社会创新文化,推动大湾区背景下深圳城市科技创新生态系统持续优化发展。