根据横琴口岸二期工程建设的整体安排，客货车联合一站式查验的部分车道(横琴往澳门方向6条车道，澳门往横琴方向9条车道)已完成建设，经琴澳两地相关部门协商一致，定于2023年9月26日15时开通试运行。同时，莲花大桥全线恢复通车。此外，澳门大学连接横琴口岸通道桥车道同步开通启用，该通道桥人行道则受旧交通平台整改工程影响暂未能同步启用。
新通关车道采用“合作查验，一次放行”(联合一站式)创新查验模式，实现出入境车辆“一次排队，一次放行”。原通关车道暂停使用，原可随车通关人员(例如70岁或以上长者、10岁或以下儿童、孕妇及残障人士)准则和往来粤澳口岸原货车通关安排维持不变。
